Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms