Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP5Q6NZY7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms