Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms