Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
LHX8Q68G74 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LHX8Q68G74 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LHX8Q68G74 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LHX8Q68G74 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LHX8Q68G74 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LHX8Q68G74 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
LHX8Q68G74 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LHX8Q68G74 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LHX8Q68G74 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LHX8Q68G74 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LHX8Q68G74 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LHX8Q68G74 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LHX8Q68G74 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LHX8Q68G74 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LHX8Q68G74 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LHX8Q68G74 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LHX8Q68G74 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LHX8Q68G74 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LHX8Q68G74 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LHX8Q68G74 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LHX8Q68G74 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LHX8Q68G74 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LHX8Q68G74 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LHX8Q68G74 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LHX8Q68G74 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LHX8Q68G74 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LHX8Q68G74 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LHX8Q68G74 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHX8Q68G74 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHX8Q68G74 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LHX8Q68G74 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHX8Q68G74 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHX8Q68G74 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHX8Q68G74 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LHX8Q68G74 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
LHX8Q68G74 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LHX8Q68G74 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LHX8Q68G74 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LHX8Q68G74 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHX8Q68G74 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LHX8Q68G74 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LHX8Q68G74 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHX8Q68G74 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LHX8Q68G74 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LHX8Q68G74 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LHX8Q68G74 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHX8Q68G74 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHX8Q68G74 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LHX8Q68G74 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHX8Q68G74 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LHX8Q68G74 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LHX8Q68G74 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LHX8Q68G74 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LHX8Q68G74 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LHX8Q68G74 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LHX8Q68G74 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LHX8Q68G74 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LHX8Q68G74 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LHX8Q68G74 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LHX8Q68G74 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LHX8Q68G74 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LHX8Q68G74 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LHX8Q68G74 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LHX8Q68G74 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LHX8Q68G74 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LHX8Q68G74 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LHX8Q68G74 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LHX8Q68G74 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LHX8Q68G74 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LHX8Q68G74 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LHX8Q68G74 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LHX8Q68G74 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LHX8Q68G74 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LHX8Q68G74 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LHX8Q68G74 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LHX8Q68G74 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LHX8Q68G74 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LHX8Q68G74 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LHX8Q68G74 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LHX8Q68G74 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LHX8Q68G74 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LHX8Q68G74 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LHX8Q68G74 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LHX8Q68G74 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LHX8Q68G74 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LHX8Q68G74 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LHX8Q68G74 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LHX8Q68G74 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LHX8Q68G74 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LHX8Q68G74 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LHX8Q68G74 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LHX8Q68G74 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LHX8Q68G74 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LHX8Q68G74 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LHX8Q68G74 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LHX8Q68G74 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LHX8Q68G74 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms