Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
C9orf84Q5VXU9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms