Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP9Q5VTM2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms