Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms