Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms