Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CEP170Q5SW79 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
CEP170Q5SW79 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
CEP170Q5SW79 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CEP170Q5SW79 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CEP170Q5SW79 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
CEP170Q5SW79 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CEP170Q5SW79 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CEP170Q5SW79 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
CEP170Q5SW79 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CEP170Q5SW79 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CEP170Q5SW79 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CEP170Q5SW79 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CEP170Q5SW79 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CEP170Q5SW79 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CEP170Q5SW79 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CEP170Q5SW79 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CEP170Q5SW79 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CEP170Q5SW79 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CEP170Q5SW79 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CEP170Q5SW79 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CEP170Q5SW79 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CEP170Q5SW79 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CEP170Q5SW79 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
CEP170Q5SW79 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CEP170Q5SW79 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CEP170Q5SW79 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms