Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms