Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms