Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms