Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms