Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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