Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN2Q52LD8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms