Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms