Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
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