Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1FQ16864 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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