Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 AP000280.1-201ENST00000624800 832 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 AC068205.1-201ENST00000526615 689 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
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FOXD1Q16676 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
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FOXD1Q16676 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 AC093227.1-201ENST00000588040 1360 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
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