Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
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