Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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