Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
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