Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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RPE65Q16518 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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RPE65Q16518 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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RPE65Q16518 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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RPE65Q16518 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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RPE65Q16518 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
RPE65Q16518 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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