Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms