Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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