Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYCP1Q15431 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYCP1Q15431 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP1Q15431 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP1Q15431 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP1Q15431 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP1Q15431 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP1Q15431 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP1Q15431 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP1Q15431 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP1Q15431 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP1Q15431 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP1Q15431 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP1Q15431 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP1Q15431 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP1Q15431 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP1Q15431 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP1Q15431 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP1Q15431 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP1Q15431 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP1Q15431 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP1Q15431 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP1Q15431 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP1Q15431 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP1Q15431 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP1Q15431 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP1Q15431 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP1Q15431 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP1Q15431 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP1Q15431 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SYCP1Q15431 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP1Q15431 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP1Q15431 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP1Q15431 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP1Q15431 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP1Q15431 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP1Q15431 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP1Q15431 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP1Q15431 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP1Q15431 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP1Q15431 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SYCP1Q15431 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP1Q15431 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP1Q15431 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
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