Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF4Q15306 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF4Q15306 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF4Q15306 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF4Q15306 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF4Q15306 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF4Q15306 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF4Q15306 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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