Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
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