Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
R3HDM1Q15032 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
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