Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCAPD2Q15021 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms