Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms