Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCINQ13939 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCINQ13939 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCINQ13939 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCINQ13939 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCINQ13939 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCINQ13939 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCINQ13939 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCINQ13939 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCINQ13939 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCINQ13939 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCINQ13939 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCINQ13939 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCINQ13939 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CCINQ13939 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCINQ13939 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCINQ13939 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCINQ13939 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCINQ13939 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCINQ13939 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCINQ13939 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCINQ13939 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCINQ13939 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCINQ13939 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCINQ13939 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCINQ13939 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCINQ13939 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCINQ13939 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCINQ13939 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCINQ13939 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCINQ13939 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCINQ13939 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCINQ13939 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCINQ13939 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCINQ13939 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCINQ13939 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCINQ13939 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCINQ13939 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CCINQ13939 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCINQ13939 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CCINQ13939 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CCINQ13939 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCINQ13939 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCINQ13939 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCINQ13939 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CCINQ13939 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCINQ13939 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCINQ13939 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCINQ13939 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCINQ13939 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCINQ13939 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCINQ13939 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCINQ13939 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCINQ13939 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCINQ13939 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CCINQ13939 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCINQ13939 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCINQ13939 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCINQ13939 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCINQ13939 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCINQ13939 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCINQ13939 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCINQ13939 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCINQ13939 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCINQ13939 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCINQ13939 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCINQ13939 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCINQ13939 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCINQ13939 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCINQ13939 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCINQ13939 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCINQ13939 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCINQ13939 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCINQ13939 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCINQ13939 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCINQ13939 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCINQ13939 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCINQ13939 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCINQ13939 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCINQ13939 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCINQ13939 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCINQ13939 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCINQ13939 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCINQ13939 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCINQ13939 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCINQ13939 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCINQ13939 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCINQ13939 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCINQ13939 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCINQ13939 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCINQ13939 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCINQ13939 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCINQ13939 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCINQ13939 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCINQ13939 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCINQ13939 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCINQ13939 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCINQ13939 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCINQ13939 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCINQ13939 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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