Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
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