Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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