Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
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