Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
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