Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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SGCGQ13326 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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SGCGQ13326 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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