Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms