Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
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