Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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