Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4Q12950 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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