Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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FOXC1Q12948 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
FOXC1Q12948 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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