Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFCP2Q12800 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFCP2Q12800 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms