Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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