Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPSF1Q10570 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
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