Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CGNL1Q0VF96 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms