Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms