Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms