Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLEQ07864 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLEQ07864 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLEQ07864 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLEQ07864 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLEQ07864 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLEQ07864 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLEQ07864 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLEQ07864 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLEQ07864 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLEQ07864 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLEQ07864 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLEQ07864 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLEQ07864 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLEQ07864 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLEQ07864 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLEQ07864 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLEQ07864 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLEQ07864 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLEQ07864 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLEQ07864 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLEQ07864 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
POLEQ07864 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLEQ07864 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLEQ07864 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLEQ07864 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLEQ07864 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLEQ07864 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLEQ07864 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLEQ07864 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLEQ07864 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLEQ07864 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
POLEQ07864 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLEQ07864 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLEQ07864 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLEQ07864 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLEQ07864 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLEQ07864 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLEQ07864 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLEQ07864 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLEQ07864 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLEQ07864 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLEQ07864 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLEQ07864 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLEQ07864 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLEQ07864 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLEQ07864 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLEQ07864 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLEQ07864 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLEQ07864 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLEQ07864 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLEQ07864 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLEQ07864 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLEQ07864 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLEQ07864 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLEQ07864 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLEQ07864 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
POLEQ07864 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLEQ07864 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLEQ07864 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLEQ07864 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLEQ07864 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLEQ07864 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLEQ07864 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLEQ07864 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLEQ07864 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLEQ07864 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLEQ07864 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLEQ07864 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLEQ07864 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLEQ07864 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLEQ07864 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
POLEQ07864 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
POLEQ07864 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLEQ07864 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLEQ07864 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLEQ07864 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLEQ07864 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLEQ07864 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLEQ07864 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLEQ07864 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLEQ07864 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLEQ07864 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLEQ07864 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLEQ07864 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLEQ07864 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLEQ07864 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLEQ07864 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLEQ07864 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLEQ07864 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLEQ07864 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLEQ07864 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLEQ07864 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLEQ07864 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
POLEQ07864 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
POLEQ07864 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLEQ07864 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLEQ07864 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLEQ07864 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLEQ07864 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms