Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms